游戏系统
科研系统
科研系统须玩家等级达到30级后开放。这个系统分为“军部科研室”及“开发船坞”。
“军部科研室”内可以通过完成研发项目，获得用于强化方案舰的蓝图、各种装备设计图和各种道具。
“开发船坞”内可以通过完成研究任务，获得强力方案舰，并用蓝图对方案舰进行强化。
交易系统
在茗喵商店可以购买身份变更证明、誓约之戒、物资、快速完成工具、心智魔方、扩展卡等功能道具，优惠礼盒、钻石以及舰船的服装。
在舰队商店，成员可使用舰队币兑换包括自选的强化部件、舰船、科技箱、技能书、改造图纸等商品。
团队系统
大舰队是《碧蓝航线》的团队系统，玩家可以选择创建一个新的大舰队或者加入一个已存在的大舰队。大舰队进入后分为：大厅、成员、后勤、科技、作战五个模块。供未加入大舰队的指挥官使用舰队后勤与科技功能以及获取舰队币。
按经营方针可分为休闲舰队和最强舰队，司令有变更权限，变更无任何限制。按阵营可分为碧蓝航线和赤色中轴，司令有变更权限，但每次更换阵营后，30天内不得再次变更。舰队司令有修改舰队宣言的权限。舰队司令有修改舰队名称的权限，每次修改需要100钻石。
关卡介绍
常规关卡
常规关卡是玩家点击游戏首页的出击按钮后默认会看到的关卡，包含普通和困难两个难度。通过点击出击界面左下角的“困难”按钮可在两种难度之间切换。
常规关卡中第1~13章海域，达成CLEAR后可开启周回模式，出击时无伏击、无空袭、可锁定阵容等。
困难难度常规关卡
关卡boss掉落改造图纸和核心数据，是这两者的主要来源。
困难模式关卡不会使用玩家在编队界面配置好的队伍，而是在进入前编队。
队伍部分位置会限制舰船的种类，只有在前排后排各有一只满足种类限制的舰船时，该队伍才能进入该关卡。
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